A felsőfokú szakképzések széles köre megnehezíti a felsőoktatás átláthatóságát, ezért az új rendszerben jelentősen csökkeni fog ezeknek a kétéves képzéseknek a száma. A sárospataki Comenius Tanítóképző Főiskolán csak a csecsemőgondozó szakképzés marad változatlan, a többit fokozatosan beépítik az alapképzésekbe, azaz a tanító és az óvodapedagógus szakokba. Ez a változás lehetőséget ad a főiskolának arra is, hogy új szakirányokat indítson a már meglévő képzéseik részeként, és a szomszéd országok egyetemeivel is szorosabbra fűzheti a kapcsolatokat.
Jelentős változások várhatók a felsőoktatási szakképzések körében. A sárospataki Comenius Főiskolán ez szinte minden ilyen jellegű kurzust érint. Az eddigi széles választékot jelentősen szűkíti az új felsőoktatási rendszer.